退火温度计算(退火温度)
发布时间:2024-06-08 22:43:34来源:
通常来说,退火温度是由引物的GC%含量决定的,但是反应体系的条件改变也会影响引物的退火温度(如Mg,Na等离子浓度)。
建议你去http://www.***.com/analyzer/Applications/OligoAnalyzer/分析一下你的PCR体系中的引物退火温度,而不是仅仅由公式计算得出。
一般情况下,退火温度过低只会导致反应体系中引物与DNA模板的非特异性结合,致使反应结果中出现大量非特异性结合条带。
但是,你所需的产物也应该是包含在其中的,如果完全没有结果,说明你反应体系中其他步骤还存在问题,例如扩增时间等比较关键的步骤。
另:不同的hot taq酶对Tm要求也是不同的。
例如今年clontech新出了一种十分nb的hot taq酶,它需要的Tm温度是引物Tm温度再高5度。
所以,弄清楚你试剂盒的反应条件要求也是很有必要的...。
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